Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.6 ms