Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MINDY3Q9CV28 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MINDY3Q9CV28 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms