Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smurf1Q9CUN6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms