Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a2Q9CTG6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms