Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc96Q9CR92 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc96Q9CR92 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms