Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms