Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ykt6Q9CQW1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ykt6Q9CQW1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms