Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms