Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl35Q9CQL6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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