Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bcl11bQ99PV8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11bQ99PV8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms