Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf8Q99PV0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms