Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ms4a4dQ99N05 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ms4a4dQ99N05 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ms4a4dQ99N05 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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