Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd1Q99MV1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd1Q99MV1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms