Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrrtQ99MR6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrrtQ99MR6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms