Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp16Q99LG0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp16Q99LG0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms