Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TriobpQ99KW3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms