Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99KU6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99KU6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99KU6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99KU6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99KU6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99KU6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q99KU6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q99KU6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q99KU6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q99KU6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q99KU6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q99KU6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q99KU6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q99KU6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q99KU6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q99KU6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q99KU6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q99KU6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms