Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmp1Q99KU0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmp1Q99KU0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms