Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf19Q99KP6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf19Q99KP6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms