Protein–RNA interactions for Protein: Q99K99

Uncharacterized protein C4orf19 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99K99 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99K99 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99K99 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99K99 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99K99 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99K99 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99K99 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99K99 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99K99 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99K99 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99K99 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99K99 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99K99 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms