Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tlcd1Q99JT6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlcd1Q99JT6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms