Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Letmd1Q924L1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms