Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Afg3l1Q920A7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1Q920A7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms