Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms