Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE4

UPF0729 protein C18orf32 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WE4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q91WE4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q91WE4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q91WE4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q91WE4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q91WE4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q91WE4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q91WE4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q91WE4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q91WE4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q91WE4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q91WE4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q91WE4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q91WE4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q91WE4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q91WE4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q91WE4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q91WE4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q91WE4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q91WE4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q91WE4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q91WE4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q91WE4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q91WE4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q91WE4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q91WE4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q91WE4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q91WE4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms