Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng5Q8VHW4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms