Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhdc3Q8VEM9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc3Q8VEM9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms