Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps4aQ8VEJ9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps4aQ8VEJ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms