Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc115Q8VE99 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms