Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gipc3Q8R5M0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms