Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms