Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Colec12Q8K4Q8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Colec12Q8K4Q8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms