Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rdh16f2Q8K3M1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rdh16f2Q8K3M1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Rdh16f2Q8K3M1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Rdh16f2Q8K3M1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Rdh16f2Q8K3M1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Rdh16f2Q8K3M1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rdh16f2Q8K3M1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rdh16f2Q8K3M1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rdh16f2Q8K3M1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rdh16f2Q8K3M1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rdh16f2Q8K3M1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rdh16f2Q8K3M1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Rdh16f2Q8K3M1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rdh16f2Q8K3M1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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