Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms