Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd3Q8K2F0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms