Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd3Q8K1Y2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms