Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm17Q8JZX4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms