Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tshz3Q8CGV9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tshz3Q8CGV9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms