Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp2Q8CGR7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms