Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hpf1Q8CFE2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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