Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc63Q8CDV6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms