Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CC96 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8CC96 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8CC96 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8CC96 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CC96 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CC96 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CC96 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CC96 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CC96 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CC96 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CC96 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CC96 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CC96 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms