Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cwc22Q8C5N3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms