Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms