Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms