Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tnfsfm13Q8BXS2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfsfm13Q8BXS2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tnfsfm13Q8BXS2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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