Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn17Q8BXA6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Cldn17Q8BXA6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Cldn17Q8BXA6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Cldn17Q8BXA6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn17Q8BXA6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn17Q8BXA6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn17Q8BXA6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn17Q8BXA6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn17Q8BXA6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn17Q8BXA6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn17Q8BXA6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn17Q8BXA6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn17Q8BXA6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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