Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s2Q8BSZ2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s2Q8BSZ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s2Q8BSZ2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s2Q8BSZ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s2Q8BSZ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s2Q8BSZ2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s2Q8BSZ2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s2Q8BSZ2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s2Q8BSZ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms