Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap4Q8BMK4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ckap4Q8BMK4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms