Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DseQ8BLI4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DseQ8BLI4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms